Rolnicy zobowiązani są do podejmowania działań mających na celu zmniejszenie zanieczyszczenia wód azotanami pochodzącymi ze źródeł rolniczych oraz zapobiebagnie dalszemu zanieczyszczeniu. Powyższe czynności wynikają z ustawy z dn. 20 lipca 2017 r. Prawo wodne (Dz. U. z 2018 r. poz. 2268 z późn. zm.) oraz rozporządzenia Rady Ministrów z dn. 5 czerwca 2018 r.

Zgodnie z ustawą Prawo wodne organem dokonującym kontroli jest Inspekcja Ochrony Środowiska. Zakres kontroli obejmuje, m.in. stosowanie nawozów na glebach zamarzniętych, zalanych wodą, nasyconych wodą lub przykrytych śniegiem, rolnicze wykorzystanie nawozów w pobliżu wód powierzchniowych, rolnicze wykorzystanie nawozów na terenach o dużym nachyleniu, okresy nawożenia, warunki przechowywania nawozów naturalnych oraz postępowanie z odciekami, dawki, sposoby i plany nawożenia azotem, umowy w formie pisemnej dotyczące zbycia nawozów naturalnych do bezpośredniego rolniczego wykorzystania, dokumentację terminów zbioru, daty stosowania nawozów, stosowane nawozy i ich dawki oraz terminy siewu jesiennych  upraw, mapy, szkice działek z zaznaczeniem lokalizacji pryzm oraz daty złożenia obornika w danym roku na danej działce.

Podczas dotychczas przeprowadzonych kontroli, najczęściej stwierdzanymi nieprawidłowościami były: brak dokumentacji, stosowanie nawozów w terminach, w których wykorzystanie jest niedozwolone, odcieki z płyty obornikowej, niewłaściwe magazynowanie kiszonki, przekroczenie maksymalnej dozwolonej do stosowania dawki nawozów naturalnych, zlokalizowanie pryzmy na terenie o spadku wyższym niż 3%.

W przeprowadzanych kontroli Podlaski Wojewódzki Inspektor Ochrony Środowiska może wydać decyzje administracyjne ustalające termin usunięcia nieprawidłowości oraz obowiązek uiszczenia opłaty.